La estructura del programa de Doctorado consta de dos periodos:
Para el periodo docente se puede consultar la página del Máster Universitario en Sistemas Telemáticos e Informáticos.
En el periodo de investigación el alumno podrá elegir un tema de investigación perteneciente a alguna de las líneas de investigación de los grupos de investigación que participan en este programa oficial de posgrado. Una vez definido el trabajo de investigación, el alumno realizará una tesis doctoral con la supervisión de un doctor.